Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA4Q8IV77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms