Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM139Q8IV31 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms