Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms