Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX29P2Q8IUI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms