Protein–RNA interactions for Protein: Q86YB7

ECHDC2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC2Q86YB7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHDC2Q86YB7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC2Q86YB7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms