Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms