Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDPD3Q7L5L3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms