Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY3Q7L099 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms