Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP31Q70CQ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP31Q70CQ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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