Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM179Q6ZVK1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms