Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms