Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A48Q6ZT89 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms