Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms