Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms