Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMFQ6X4W1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms