Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP12Q6UXS9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms