Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO3Q6UWJ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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