Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L2Q6R6M4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L2Q6R6M4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms