Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFCAB12Q6NXP0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFCAB12Q6NXP0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms