Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms