Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms