Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAT2Q6NUI2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAT2Q6NUI2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms