Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCSD1Q6JBY9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms