Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q5VSD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q5VSD8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q5VSD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q5VSD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms