Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.2 ms