Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC18Q5T9S5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC18Q5T9S5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms