Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms