Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms