Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF394Q53GI3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms