Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL12Q53G59 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms