Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC184Q52MB2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms