Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A12Q504Y0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms