Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP28Q4G0W2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms