Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms