Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP100Q494V2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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