Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms