Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms