Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LETM2Q2VYF4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETM2Q2VYF4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms