Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA9Q16790 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA9Q16790 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA9Q16790 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA9Q16790 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CA9Q16790 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CA9Q16790 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CA9Q16790 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CA9Q16790 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA9Q16790 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA9Q16790 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CA9Q16790 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CA9Q16790 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms