Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TNXAQ16473 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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