Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GABRA6Q16445 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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