Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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SSX1Q16384 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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SSX1Q16384 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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SSX1Q16384 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SSX1Q16384 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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SSX1Q16384 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SSX1Q16384 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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