Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE3CQ15386 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE3CQ15386 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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