Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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