Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCOLCEQ15113 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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