Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF235Q14590 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF235Q14590 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF235Q14590 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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