Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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