Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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