Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms