Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CUL3Q13618 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CUL3Q13618 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CUL3Q13618 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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